莱默无脊椎动物基因组学实验室
莱默无脊椎动物基因组学实验室
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About
莱默博士(CV)
海洋无脊椎动物基因组学助理教授
pg电子海洋实验室
UOG站，美国关岛曼吉劳96923
sarah.lemer@gmail.com
其他关系:
研究助理
有机学系 & 进化生物学
比较动物学博物馆
哈佛大学
研究兴趣
莱默实验室的研究重点是了解生物多样性是如何产生和存在的
在海洋无脊椎动物中，在物种、种群和个体水平上，
在不断变化的环境中.
pg电子的工作主要集中在不同的软体动物群体，但pg电子也探索更广泛的 海洋无脊椎动物领域来解决pg电子的研究问题(pg电子甚至有时 冒险进入脊椎动物的世界!).
在莱默实验室pg电子主要采用野外工作相结合，实验控制 下一代测序方法(RNA-Seq, RAD-Seq, Tag-Seq和 基因组测序)和生物信息学来回答关于群体遗传学的问题， 环节动物、双壳类、头足类等不同类群的系统发育及基因表达 以及硬壳珊瑚.
莱默实验室代表着不分种族的公正和平等对待， 出身，性别或性取向. 因此，pg电子提倡包容、反种族主义、反性别歧视 反歧视的做法. PI将致力于积极推进工作 女性、有色人种和太平洋岛民在实验室和教室里都有机会 例如科学教育，实验室经验，会议出席和推广. We 欢迎新的学生和博士后谁分享pg电子的价值观，并对无脊椎动物充满热情 进化基因组学，联系我: sarah.lemer@gmail.com
我是美国国家科学基金会资助的关岛生态系统合作馆的一员. 了解更多 we do here: Guam EPSCoR
当前的项目
漂白的阻力
pg电子在水族箱实验中使用的是重现极端环境条件 导致珊瑚白化. 目的是鉴定和表征分子 这些过程使得一些珊瑚能够适应极端的环境条件并存活下来 而其他人通常会漂白或死亡.
双壳类动物Phylogenomics
特别是双壳类动物之间的系统发育关系仍然存在不确定性 在公正组内. pg电子对双壳类转录组进行测序和分析 基因组来阐明这种不同软体动物群的系统发育.
珊瑚和其他无脊椎动物种群基因组学
物种和种群对不断变化的环境条件的适应能力取决于基因 多样性和互联性. 一般来说，造礁的遗传多样性和连通性 和珊瑚礁相关类群(e.g.珊瑚、甲壳类动物、藻类、软体动物)的生存状况很差 在西太平洋的理解，这是pg电子要解决的问题. 可以说是最 在美国管辖范围内，关岛和CNMI代表了一个独特的珊瑚礁生态系统 有机会研究气候变化下珊瑚礁的连通性和恢复力. Recovery 底栖生物群落受干扰后的生存依赖于连通性，但也有依赖性 在生态过程中，比如从附近种群中招募幼虫. We 正在探索多种珊瑚的遗传连通性、多样性和结构 使用RAD-Seq或浅全基因组测序方法对密克罗尼西亚的物种进行测序.
研究物种: Trapezia crabs, Tridacna clams, Drupella 蜗牛,床, 黄花鹿角虫，紫花瘦叶虫, etc...
密克罗尼西亚礁鱼系统地理学
在密克罗尼西亚，渔业是当地食物和经济发展的来源， 然而鱼类在密克罗尼西亚群岛之间的移动仍然未知. pg电子希望 了解棘鱼科鱼类的遗传结构和多样性模式， 岛屿上的鹿螨科，鹿螨科和Lethrinidae.
莱默实验室团队和同事!
Postdocs
Carlos Leiva
Research: 小巨蛤种群基因组学与生物地理学 Tridacna最大值
当前位置: 博士后研究人员
海洛薇兹Rouze
Research: 植物早期应激反应的基因表达和菌群模式研究 Acropora corals
当前位置: 博士后研究人员
研究生
Kenzie波拉德
研究生研究助理
Research:的系统地理学和群体基因组学 梯形bidentata 在印度-太平洋
奥利维亚·巴里
研究生助理
Research: 耐热珊瑚的种群基因组学研究 Leptastrea紫竹 on Guam
Monica Salas
研究生助理
Research: 刺冠海星的群体遗传学 Acanthaster planci 穿越马里亚纳群岛
本科生
Laura Caser
生物学本科
Research: 辨别珊瑚食性动物的种类 Drupella 关岛的蜗牛
Lynn Galang
生物学本科
Alumni
Postdocs
- 皮埃尔-路易斯轮: 珊瑚适应热胁迫的表观遗传学和基因表达模式
Graduates
- 康斯坦斯裁缝: 易感人群适应的转录组特征 疣surculosa 和“耐药” Porites rus
- 维多利亚Moscato: 描述颜色在硬壳珊瑚耐热性中的作用 疣surculosa
本科生
- 日兴Galanto: 热应激对繁殖的影响 Leptastrea紫竹
- Anela女仆: 沉积物应力 Acropora corals
- Amhiya Cacapit: 沉积物应力 Acropora corals
- 米克尔Lizama: 热应激对繁殖的影响 Leptastrea紫竹
- 查尔斯Hambley: 在珊瑚中触发发光表型的非生物条件的特征.
- 乔安娜Panaguiton: 热应激对繁殖的影响 Leptastrea sp. corals.
- 茉莉花Rotan: 密克罗尼西亚礁鱼系统地理学
选定的出版物
2021
- YH. Phua*, MC. Roy, S. Lemer, F. Husnik, KC. Wakeman. 2021. 底栖鞭毛藻太平洋品系的多样性及毒性研究 Coolia (恐龙科)，一起看看 Coolia canariensis 种类复杂. 有害藻类. 109: 102-120
- V. Fabian**, P. Houk, S. Lemer. 2021. 密克罗尼西亚帝王鱼系统发育关系的解析. 分子系统发育和进化. 162 (2021):107207
- J. Moles, TJ. Cunha, S. Lemer, D. Combosch, G. Giribet. 2021. 系紧腰带:多齿蕨的植物转录组学. 软体动物研究杂志 84 (2): eyab019
- P. Houk, S. Lemer, D. Hernandez, J. Cuetos-Bueno. 2021. 利用系统发育预测密度的珊瑚礁渔业的进化管理 dependance. 生态应用程序 :e02409
- Fifer*, B. Bentlage, S. Lemer, A. Fujimura, M. Sweet, L. Raymundo. 2021. 随波逐流:高水流中的珊瑚 环境可以战胜炎热. 分子生态y http://doi.org/10.1111/mec.15869
2020
- Li; S. Lemer; L. Kirkendale; R. Bieler; C. Cavanaugh; G. Giribet. 2020. 揭示:系统转录组学 透视说明海洋双壳类生物光共生的起源. BMC进化生物学, 20, 1-15
2019
- Laumer, R. Fernandez, S. Lemer, D. Combosch, K. Kocot, A. Riesgo, S. Andrade, W. Sterrer, M. Sorensen, G. Giribet. 2019. 用所有门的基因组取样重访后生动物系统发育. 英国皇家学会学报B: 286
- S. Lemer, R. Bieler, G. Giribet. 2019. 解决蛤蜊和蛤的关系:密集 转录组取样极大地改善了双壳类生命树. 英国皇家学会学报B: 283
- T. Cunha, S. Lemer, P. Bouchet, Y. Kano, G. Giribet. 2019. 把锁孔帽贝放在地图上:系统发育 全球海洋科裂鳃科生物地理研究(麻足纲，软体目). 分子系统发育与进化; 135:249-269
2017
- D. Combosch*, S. Lemer*, N. Landman, P. Ward, G. Giribet. 2017. 鹦鹉螺活化石进化的基因组特征. 分子生态学, 26:5923-5938. *共享第一作者身份
- PUPA. Gilbert, KD. Bergmann, CE. Myers, RT. DeVol, CY. Sun, AZ. Blonsky, J. Zhao, EA. Karan, E. Tamre, N. Tamura, MA. Marcus, AJ. Giuffre, S. Lemer, G. Giribet, JE. Eiler, AH. Knoll. 2017. 珍珠片厚度记录了现代和化石贝壳的形成温度. 地球与行星科学通讯; 460:281-292
2016
- D. Combosch; TM. Collins; EA, Glover; DL. Graf; EM. Harper; JM. Healy; GY. Kawauchi; S. Lemer; E. McIntyre; EE. Strong; JD. Taylor; JD. Zardus; PM. Mikkelsen; G. Giribet, R. Bieler. 2017. 基于sanger测序方法的双壳类生物家族级生命树. 分子系统发育和进化， 107: 191-208
- S. Lemer, D. Combosch, D. Dumale, F. Sotto, V. Soliman, G. Giribet. 2016. 羽菜科 (软体动物，双壳纲)在菲律宾群岛:其分布的观察 和phylogeography. The Nautilus, 130:4.
- S. Lemer, V. González, R. Bieler, G. Giribet,. 2016. 在翼形纲中将贻贝与牡蛎粘合在一起 树:系统发育学方法. 英国皇家学会学报B, 283:1833
2015
- S. Lemer, D. Saulnier, Y. Gueguen, S. Planes,. 2015. 相关基因的鉴定 黑唇珍珠牡蛎的壳色. BMC基因组学, 16:568
- S. Lemer, GY. 川内，CS Andrade, MJ Boyle, G. Giribet,. 2015. 重新评估系统发育 通过转录组学来研究星形虫. 分子系统发育和进化, 83: 174-183
- R. Fernandez*, S. Lemer*, G. Giribet,. 2015. 比较系统地理学和群体遗传结构 地中海和大西洋附近三种广泛分布的软体动物. 海洋生态, 36: 701-715. *共享第一作者身份
2014
- S. Lemer & G. Giribet,. 2014. 一种栖息于双壳类的海洋水螅类(水螅目， 1791年琥珀笔壳Pinna carnea Gmelin(双壳亚种) 羽形虫，羽形虫科)来自博卡斯德尔托罗. 软体动物研究杂志, 80: 464-468
- G. Giribet, S. Lemer,. 2014. 关于Tuleocaris疏忽的发生，Chace, 1969(十足纲，古蚤科， 在Echinometra lucunter (Linnaeus, 1758)中的Pontoniinae(棘皮纲，棘皮总科， 在巴拿马的博卡斯德尔托罗群岛. Crustaceana, 87: 634-638
- S. Lemer & S. Planes,. 2014. 生境破碎化对遗传结构和遗传结构的影响 黑唇珍珠牡蛎珠母贝种群的连通性 法属波利尼西亚. 海洋生物学, 161: 2035-2049
- S. Lemer, B Buge, A. Bemis, G. Giribet. 2014. 第一个环热带的分子系统发育 双壳科羽螺科(软体动物纲，双壳纲):高水平隐体的证据 物种多样性. 分子系统发育和进化, 75: 11-23
2012
- S. Lemer & S. Planes,. 2012. 野生种群迁移:保护意义 黑唇珍珠牡蛎(种胎)的遗传多样性. 分子生态学, 21: 2949-2962
- A.C. Stier, M.A. Gil, C.S. McKeon, S. Lemer, M. Leray, S.C. Mills, C.W. Osenberg,. 2012. 家政互助:做更多的共生体 提升主机性能? PLoS ONE 7(4):e32079. doi:10.1371/journal.pone.0032079
2011
- S. Lemer, E. Rochel, S. Planes,. 2011. 种中零等位基因的校正方法 可变微卫星侧翼区域，以黑唇珍珠牡蛎为例 种胎. 遗传杂志, 102 (2) 243-246
- S. Planes & S. Lemer,. 2011. 基于个体的分析为了解人口提供了新的见解 结构与动物行为. 分子生态学, 20: 187-189
2007
- P. Borsa, S. Lemer, D. Aurelle,. 2007. 家兔鱼的谱系多样化模式. 分子系统发育和进化, 44: 427-435.
2006
- S. Lemer , D. Aurelle, L. Vigliola, J.D. Durand, P. Borsa,. 2006. 细胞色素b条形码， 兔鱼科的分子系统学和地理分异. Comptes Rendus生物学, 330 (1): 86-94.
教学:生物学研究生班
Bi-546海洋无脊椎动物
FALL
4个学时
BI546是一门4学分的研究生水平课程，它将向你介绍专业(和专业) 不太大的)海洋无脊椎动物门. 讲座将涉及更高层次的主题 系统发育，解剖和形态多样性，生活史，生态学，解剖学 以及各组的生理状况. 实验室将与代表一起提供实践经验 pg电子这节课要讲的群体. pg电子也会去实地考察，这样你 能在野外获得识别无脊椎动物的经验吗. 这个班将会在下午见面 每周二和周四下午2:00-3:20有两节课，还有一次实验室 星期五下午1:00-3:50.
Bi-691研讨会:生物地理学概论
SPRING
1个学分
BI691是一门1学分的研究生水平课程，将向您介绍生态 以及影响生物分布的历史进程. 以下主题 通过科学论文介绍和讨论:板块构造 地球历史，地理分布和扩散，地方性，保护生物地理学， 物种丰富度的纬度梯度与岛屿生物地理学理论.
